Koufonisia si trova a sedici miglia nautiche a sud-est di Naxos, l'ultimo avamposto abitato di una catena sparsa che i greci chiamano Piccole Cicladi. L'arcipelago—Donoussa, Schinoussa, Iraklia e gli isolotti gemelli di Ano e Kato Koufonisi—è rimasto privo di insediamenti permanenti fino al XIX secolo, quando i pescatori di spugne e i pastori costruirono le prime case in pietra sopra gli ancoraggi dei pescherecci. Il servizio di traghetti dal Porto di Naxos è iniziato nel 1989, collegando le isole al centro regionale due volte a settimana; entro il 2010, le partenze giornaliere in estate hanno trasformato Koufonisia in una nota a piè di pagina negli itinerari dei viaggiatori zaino in spalla. La traversata dura novanta minuti a bordo di traghetti convenzionali che partono ogni mattina dalla banchina commerciale di Chora, o tre ore sui traghetti più lenti che proseguono verso sud fino ad Amorgos. Alternative più veloci sono emerse negli anni 2010: catamarani a vela e gommoni a scafo rigido che partono da Agia Anna, un borgo balneare sulla costa meridionale di Naxos, riducendo il viaggio a quarantacinque minuti e permettendo di ancorare alla Grotta di Rina, una grotta marina crollata sulla punta sud-orientale di Kato Koufonisi, accessibile solo via mare. Queste crociere giornaliere solitamente includono un barbecue greco cucinato a bordo, soste per lo snorkeling nelle secche turchesi tra gli isolotti e due ore a terra nell'unico villaggio di Ano Koufonisi, dove diciannove residenti permanenti gestiscono taverne stagionali e affittano camere sopra il porto peschereccio. La geologia è puro calcare: il nome Koufonisia deriva da kófos, cavo, un riferimento alla rete di grotte marine e camere crollate che costellano il litorale. Secoli di moto ondoso hanno scavato ponti naturali, tunnel e archi nelle scogliere. Le isole non producono acqua dolce; le cisterne raccolgono l'acqua piovana invernale e le scorte estive arrivano tramite chiatte cisterna. La vegetazione è scarsa—timo selvatico, fico d'india e macchia bassa—lasciando la roccia bianca esposta sotto un cielo che mantiene la sua intensità blu da aprile a ottobre. Una gita in barca da Naxos a Koufonisia rimane l'unico modo pratico per raggiungere l'arcipelago. Non esiste un aeroporto e l'orario dei traghetti si riduce drasticamente dopo settembre. La finestra di partenza mattutina, tra le nove e mezzogiorno, evita i venti pomeridiani del meltemi che possono rendere la traversata di ritorno scomoda in acque esposte.